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这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本，请参见GUIDEseq．

GUIDE-seq分析管道

Bioconductor版本:3.2

该软件包实现了GUIDE-seq分析工作流，包括获取唯一插入位点(解理事件的代理)、估计解理位点(即峰值)的位置、从正负链合并估计的解理位点，以及对解理位点周围的扩展区域进行脱靶搜索的功能。

作者:朱丽华，迈克尔·劳伦斯，安基特·古普塔，阿尔珀·库库库拉尔，曼努埃尔·加伯，斯科特·沃尔夫

维护者:朱丽华朱莉<朱莉。在umassmed.edu>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GUIDEseq”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GUIDEseq”)

PDF		GUIDEseq装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneRegulation，测序，软件，WorkflowStep
版本	1.0.4
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(0.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.2.0)，IRanges，BiocGenerics，S4Vectors
进口	BiocParallel，Biostrings，CRISPRseek，ChIPpeakAnno，GenomicRanges，data.table，matrixStats，BSgenome、并行
链接
建议	knitr，RUnit，BiocStyle，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	GUIDEseq_1.0.4.tar.gz
Windows二进制	GUIDEseq_1.0.4.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	GUIDEseq_0.99.6.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	GUIDEseq_1.0.4.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/GUIDEseq/tree/release-3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GUIDEseq/
软件包下载报告	下载数据