要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("GOstats")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

GOstats

此包适用于Bioconductor的3.2版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GOstats

操作GO和微阵列的工具。

Bioconductor版本:3.2

一套与GO和微阵列数据交互的工具。各种基本的图形操作工具,假设检验和其他简单的计算。

作者:R. Gentleman和S. Falcon

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

引用(从R中,输入引用(“GOstats”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("GOstats")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“GOstats”)

PDF 对不常见的模型生物的超几何测试
PDF 使用GOstats进行超几何测试
PDF 使用GOstats可视化数据
PDF 参考手册

细节

biocViews 注释GeneExpressionGeneSetEnrichmentGraphAndNetwork微阵列MultipleComparison通路软件
版本 2.36.0
Bioconductor自 BioC 1.6 (R-2.1)或更早版本(> 11年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.10),Biobase(> = 1.15.29),类别(> = 2.3.26),
进口 方法、统计stats4,AnnotationDbi(> = 0.0.89),Biobase(> = 1.15.29),类别(> = 2.3.26),GO.db(> = 1.13.0),RBGL注释(> = 1.13.2),(> = 1.15.15),AnnotationForge
链接
建议 hgu95av2.db(> = 1.13.0),所有GO.db(> = 1.13.0),注释genefilterRColorBrewerRgraphvizxtableSparseMGSEABasegeneplotterorg.Hs.eg.dbRUnitBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 吸引MineICARDAVIDWebService
进口我 affycoretools吸引categoryComparefacopymvGSTProCoNAReportingToolssystemPipeR
建议我 BiocCaseStudies类别eisafastLiquidAssociationGSEAlmHTSanalyzeRinteractiveDisplayMineICAmiRLAB中长期规划MmPalateMiRNAneaGUIoneChannelGUIphenoDistqpgraphRnBeads安全
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 GOstats_2.36.0.tar.gz
Windows二进制 GOstats_2.36.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) GOstats_2.36.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) GOstats_2.36.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/GOstats/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GOstats/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心