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ggtools

此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅ggtools

软件和数据用于分析基因表达的遗传学

生物导体版本:3.2

软件和数据,用于分析基因表达和/或DNA甲基化的遗传学

作者:vj Carey

维护者:vj Carey

引用(从r内,输入引用(“ ggtools”)):

安装

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PDF GGTools:用于EQTL标识的软件
PDF 参考手册
文本 读书我
文本 消息

细节

生物浏览 基因表达,,,,遗传因素,,,,遗传学,,,,SNP,,,,软件
版本 5.6.0
在生物导体中 Bioc 1.9(R-2.4)(9。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.14),GGBASE(> = 3.19.7),Data.Table, 平行
进口 方法,utils,stats,生物基因,,,,snpstats,,,,ff,,,,rsamtools,,,,AnnotationDbi,,,,生物酶,,,,少量,,,,变体,,,,Hexbin,,,,rtracklayer,,,,GVIZ,stats4,S4VECTORS,,,,iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,迭代器,,,,生物弦,,,,rocr,,,,Biglm,,,,GGPLOT2,,,,RESHAPE2
链接
建议 ggdata,,,,Illuminahumanv1.db,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp.20120608,,,,多检验,,,,AOD,,,,rmeta
系统要求
增强 matrixeqtl,,,,同性恋,,,,foreach,,,,多帕尔,,,,Gwascat
URL
取决于我 ceu1kg,,,,Cheung2010,,,,codnasei,,,,ggtut
进口我 ceuhm3
建议我 CGDV17,,,,DSQTL,,,,GGBASE,,,,GQTLBASE,,,,Gwascat,,,,Hmyrib36,,,,Ind1kg
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 ggtools_5.6.0.tar.gz
Windows二进制 ggtools_5.6.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) ggtools_5.6.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) ggtools_5.6.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/ggtools/tree/release-3.2
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ggtools/
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