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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅《创世纪》。

基因估计和推断结构样品(创世纪):统计方法分析基因的数据样本与人口结构和/或亲缘

Bioconductor版本:3.2

《创世纪》包提供了估算方法,推断,占人口和谱系结构在基因分析。当前的实现提供了函数执行pc航空(Conomos et al ., 2015)和PC-Relate (Conomos et al .,在审查)。pc航空执行全基因组SNP检测数据主成分分析人口结构的样本可能包含已知的或神秘的亲缘。与标准主成分分析,pc航空占示例提供准确血统亲缘推理不羞愧的家庭结构。PC-Relate使用祖先代表主成分调整人口结构/祖先和准确估计最近的遗传相似度指标等亲属关系系数,IBD共享概率和近亲繁殖系数。

作者:马修·p·Conomos和蒂莫西·桑顿

维护人员:马修·p·Conomos < mconomos uw.edu >

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HTML		人口结构和亲缘推理使用《创世纪》的包
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文本		新闻

细节

biocViews	BiocViews,DimensionReduction,GeneticVariability,遗传学,GenomeWideAssociation,PrincipalComponent,质量控制,单核苷酸多态性,软件,StatisticalMethod
版本	2.0.1
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	GWASTools
进口	gdsfmt
链接
建议	SNPRelate,RUnit,BiocGenerics,knitr
SystemRequirements
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构建报告

包档案

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包的来源	GENESIS_2.0.1.tar.gz
Windows二进制	GENESIS_2.0.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	GENESIS_2.0.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	GENESIS_2.0.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/genesis/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GENESIS/
包下载报告	下载数据