要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“EnrichedHeatmap”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见EnrichedHeatmap.
Bioconductor版本:3.2
富集热图是一种特殊类型的热图,它可以可视化地显示特定目标区域上基因组信号的富集。这里我们通过ComplexHeatmap包实现了丰富的热图。由于这种类型的热图只是一个普通的热图,但有一些特殊的设置,使用ComplexHeatmap的功能,自定义热图以及连接到热图列表以显示不同数据源之间的对应关系会容易得多。
作者:顾祖光
维护者:祖光谷
引文(从R内,输入引用(“EnrichedHeatmap”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“EnrichedHeatmap”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“EnrichedHeatmap”)
超文本标记语言 | 制作丰富的热图 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 报道,GenomeAnnotation,测序,软件,可视化 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.2 (R-3.2)(0.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R(>= 3.1.2),网格,ComplexHeatmap(> = 1.4.0),GenomicRanges,IRanges,locfit |
进口 | 方法,matrixStats,统计数据 |
链接 | |
建议 | testthat(> = 0.3),knitr,减价,circlize(> = 0.3.1) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/jokergoo/EnrichedHeatmap |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | EnrichedHeatmap_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | EnrichedHeatmap_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | EnrichedHeatmap_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | EnrichedHeatmap_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/EnrichedHeatmap/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/EnrichedHeatmap/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |