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埃尔默
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这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本，请参见埃尔默．
利用癌症甲基化组推断调控元件格局和转录因子网络
Bioconductor版本:3.2
ELMER旨在利用来自大量样本的DNA甲基化和基因表达来推断原代组织中的调控元件格局和转录因子网络。
作者:姚丽静[cre, aut]， Ben Berman [aut]， Peggy Farnham [aut]，沈辉[ctb]， Peter Laird [ctb]， Simon Coetzee [ctb]
维护者:Lijing Yao
引文(从R内，输入引用(ELMER))：
安装
要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ELMER”)
文档
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browseVignettes (ELMER)
| ELMER:利用甲基化体推断调控元件景观和转录因子网络 | ||
| 参考手册 |
细节
| biocViews | DNAMethylation，GeneExpression，GeneRegulation，MotifAnnotation，软件 |
| 版本 | 1.2.1 " |
| 在Bioconductor | BioC 3.2 (R-3.2)(0.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 3.2.0)，IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19，Homo.sapiens，ELMER.data |
| 进口 | 方法,BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges，ggplot2，重塑、网格gridExtra，minfi，GenomicFeatures |
| 链接 | |
| 建议 | 平行,雪，BiocStyle，knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 包的来源 | ELMER_1.2.1.tar.gz |
| Windows二进制 | ELMER_1.2.1.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | ELMER_1.1.1.tgz |
| Mac OS X 10.9 (Mavericks) | ELMER_1.2.1.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/ELMER/tree/release-3.2 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ELMER/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
