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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅剂量。

疾病本体语义和富集分析

Bioconductor版本:3.2

这个包实现了蕾斯尼克提出的五个方法,分别Schlicker,江,林和王之间的语义相似性测量条款和基因产物。富集分析包括超几何模型和基因集富集分析也发现疾病的关联实现高通量生物数据。

作者:Guangchuang Yu在gmail.com > < guangchuangyu来自李亘王弗拉季斯拉夫•Petyuk和乔凡尼达尔奥廖。

维护人员:Guangchuang于< guangchuangyu gmail.com >

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PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,GeneSetEnrichment,MultipleComparison,通路,软件,可视化
版本	2.8.3
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.1.0)
进口	方法,plyr,qvaluestats4,AnnotationDbi,DO.db,igraph,尺度,reshape2、图形、GOSemSim、网格ggplot2
链接
建议	org.Hs.eg.db,clusterProfiler,knitr,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/GuangchuangYu/DOSE
BugReports	https://github.com/GuangchuangYu/DOSE/issues
取决于我
进口我	clusterProfiler,facopy,ReactomePA
建议我	ChIPseeker,GOSemSim
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	DOSE_2.8.3.tar.gz
Windows二进制	DOSE_2.8.3.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	DOSE_2.8.1.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	DOSE_2.8.3.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/dose/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DOSE/
包下载报告	下载数据