要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“DNAcopy”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

DNAcopy

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见DNAcopy

DNA拷贝数数据分析

Bioconductor版本:3.2

采用循环二进制分割(CBS)算法对DNA拷贝数数据进行分割,识别拷贝数异常的基因组区域。

作者:Venkatraman E. Seshan, Adam Olshen

维护者:Venkatraman E. Seshan

引文(从R内,输入引用(“DNAcopy”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“DNAcopy”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“DNAcopy”)

PDF DNAcopy
PDF 参考手册

细节

biocViews CopyNumberVariation微阵列软件
版本 1.44.0
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 CGHcallcghMCR单克隆CopyNumber450kCRImagesnapCGHSomatiCA
进口我 ADaCGH2ArrayTV冠军单克隆cn.farmsCNAnormCNVrd2conumee文案GWASToolsMEDIPSMinimumDistanceQDNAseqrCGHRepitoolssnapCGHSomatiCA
建议我 beadarraySNP单克隆cn.mopsfastseggenoset
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 DNAcopy_1.44.0.tar.gz
Windows二进制 DNAcopy_1.44.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) DNAcopy_1.44.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) DNAcopy_1.44.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/DNAcopy/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/DNAcopy/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心