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这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本，请参见DESeq2．

基于负二项分布的差异基因表达分析

Bioconductor版本:3.2

基于使用负二项分布的模型，估计来自高通量测序测定的计数数据中的方差-均值依赖性，并检验差异表达。

作者:Michael Love(波士顿HSPH)， Simon Anders, Wolfgang Huber(海德堡EMBL)

维护者:Michael Love

安装

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文档

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browseVignettes(“DESeq2”)

PDF		使用“DESeq2”软件包分析RNA-seq数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，DifferentialExpression，GeneExpression，RNASeq，圣人，测序，软件
版本	1.10.1
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证	LGPL (>= 3)
取决于	S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，SummarizedExperiment(> = 0.2.0),Rcpp(> = 0.10.1),RcppArmadillo(> = 0.3.4.4)
进口	BiocGenerics(> = 0.7.5),Biobase，BiocParallel，genefilter、方法、locfit，geneplotter，ggplot2，Hmisc
链接	Rcpp，RcppArmadillo
建议	testthat，knitr，BiocStyle，vsn，pheatmap，RColorBrewer，气道，pasilla(> = 0.2.10),DESeq
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	DEXSeq，FourCSeq，MLSeq，rgsepd，移行细胞癌，XBSeq
进口我	DChIPRep，EnrichmentBrowser，FourCSeq，HTSFilter，ReportingTools，SNPhood，systemPipeR，ToPASeq
建议我	biobroom，BiocGenerics，compcodeR，DiffBind，计，oneChannelGUI，phyloseq，subSeq
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	DESeq2_1.10.1.tar.gz
Windows二进制	DESeq2_1.10.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	DESeq2_1.10.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	DESeq2_1.10.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/DESeq2/tree/release-3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DESeq2/
软件包下载报告	下载数据