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这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本，请参见DESeq．

基于负二项分布的差异基因表达分析

Bioconductor版本:3.2

基于使用负二项分布的模型，估计来自高通量测序测定的计数数据中的方差-均值依赖性，并检验差异表达

作者:Simon Anders, EMBL Heidelberg

维护者:Simon Anders

安装

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文档

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browseVignettes(“DESeq”)

PDF		使用“DESeq”软件包分析RNA-Seq数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，DifferentialExpression，RNASeq，圣人，测序，软件
版本	1.22.1
在Bioconductor	BioC 2.6 (R-2.11)(6年)
许可证	GPL (>= 3)
取决于	BiocGenerics(> = 0.7.5),Biobase(> = 2.21.7),locfit，晶格
进口	genefilter，geneplotter、方法、质量，RColorBrewer
链接
建议	pasilla(> = 0.2.10),vsn，gplots
SystemRequirements
增强了
URL	http://www-huber.embl.de/users/anders/DESeq
全靠我	DBChIP，埃达，metaseqR，Polyfit，SeqGSEA，移行细胞癌，tRanslatome
进口我	ampliQueso，ArrayExpressHTS，easyRNASeq，EDASeq，埃达，gCMAP，HTSFilter，rnaSeqMap，ToPASeq
建议我	BitSeq，compcodeR，DESeq2，dexus，DiffBind，肘，计，genefilter，GenomicAlignments，GenomicRanges，oneChannelGUI，pasilla，适当的，RUVSeq，SSPA，XBSeq
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	DESeq_1.22.1.tar.gz
Windows二进制	DESeq_1.22.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	DESeq_1.22.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	DESeq_1.22.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/DESeq/tree/release-3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DESeq/
软件包下载报告	下载数据