要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“CoverageView”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

CoverageView

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见CoverageView

R的覆盖可视化包

Bioconductor版本:3.2

该软件包为基因组覆盖剖面的可视化提供了一个框架。它可以用于ChIP-seq实验,但它也可以用于全基因组核小体定位实验或其他实验类型,其中重要的是要有一个框架,以检查覆盖如何分布在整个基因组

作者:Ernesto Lowy

维护者:Ernesto Lowy

引文(从R内,输入引用(“CoverageView”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“CoverageView”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“CoverageView”)

PDF 易于可视化的读覆盖
PDF 参考手册

细节

biocViews ChIPSeqRNASeq测序软件技术可视化
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 2.14 (R-3.1)(2年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 2.10),方法,Rsamtools(> = 1.19.17),rtracklayer
进口 BiocGenericsS4Vectors(> = 0.7.21),IRanges(> = 2.3.23),GenomicRangesGenomicAlignments,平行,工具
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 CoverageView_1.6.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) CoverageView_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) CoverageView_1.6.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/CoverageView/tree/release-3.2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/CoverageView/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心