要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“CoverageView”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见CoverageView.
Bioconductor版本:3.2
该软件包为基因组覆盖剖面的可视化提供了一个框架。它可以用于ChIP-seq实验,但它也可以用于全基因组核小体定位实验或其他实验类型,其中重要的是要有一个框架,以检查覆盖如何分布在整个基因组
作者:Ernesto Lowy
维护者:Ernesto Lowy
引文(从R内,输入引用(“CoverageView”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“CoverageView”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“CoverageView”)
易于可视化的读覆盖 | ||
参考手册 |
biocViews | ChIPSeq,RNASeq,测序,软件,技术,可视化 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 2.14 (R-3.1)(2年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 2.10),方法,Rsamtools(> = 1.19.17),rtracklayer |
进口 | BiocGenerics,S4Vectors(> = 0.7.21),IRanges(> = 2.3.23),GenomicRanges,GenomicAlignments,平行,工具 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | CoverageView_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | CoverageView_1.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | CoverageView_1.6.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/CoverageView/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CoverageView/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |