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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅文案。

从目标是使用不相干的读取的序列拷贝数信息

Bioconductor版本:3.2

文案中提取DNA拷贝数的信息有针对性的测序utiizing脱靶读取。它允许提取均匀分布拷贝数信息,可以使用没有参考,可以应用于测序数据来自各种技术包括基因染色质免疫沉淀反应和目标浓缩在小板。因此,文案构成广泛适用的选择可用的拷贝数检测工具。

作者:托马斯Kuilman

维护人员:托马斯Kuilman < t。在nki.nl kuilman >

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细节

biocViews	CopyNumberVariation,报道,ExomeSeq,预处理,软件,TargetedResequencing,可视化
版本	2.2.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(1年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.2),BiocParallel
进口	matrixStats,gtools,data.table,S4Vectors,chipseq,IRanges,Rsamtools,DNAcopy,GenomicAlignments,GenomicRanges,CopyhelpeR,GenomeInfoDb,futile.logger
链接
建议	BiocStyle,SCLCBam,雪
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/PeeperLab/CopywriteR
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	CopywriteR_2.2.0.tar.gz
Windows二进制	CopywriteR_2.2.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	CopywriteR_2.2.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	CopywriteR_2.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/copywriter/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CopywriteR/
包下载报告	下载数据