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此包适用于Bioconductor的3.2版本;有关稳定的、最新的发布版本，请参见CompGO．

一个用于。bed文件注释的R管道，比较基因集合和数据可视化之间的GO术语富集

Bioconductor版本:3.2

这个包包含完成几个任务的函数。它能够从UCSC下载完整的基因组数据库，导入。bed文件容易，注释这些。bed文件区域与上述数据库转储的基因(加上距离)，与DAVID接口创建功能注释和基因本体富集图基于基因列表(如那些从输入.bed文件生成的)，并最终可视化和比较这些富集使用有向无环图或散点图。

作者:Sam D. Bassett [aut]， Ashley J. Waardenberg [aut, cre]

维护者:Ashley J. Waardenberg

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

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文档

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browseVignettes(“CompGO”)

PDF		CompGO-vignette.pdf
PDF		介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	去，GeneSetEnrichment，MultipleComparison，软件，可视化
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (R-3.1)(2年)
许可证	GPL-2
取决于	RDAVIDWebService
进口	rtracklayer，Rgraphviz，ggplot2，GenomicFeatures，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene，pcaMethods，reshape2，pathview
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	CompGO_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	CompGO_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)	CompGO_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	CompGO_1.6.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/CompGO/tree/release-3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CompGO/
包下载报告	下载数据