要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ChromHeatMap”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见ChromHeatMap.
Bioconductor版本:3.2
ChromHeatMap包可用于沿给定染色体的每条链绘制全基因组数据(例如,表达,CGH, SNP)作为热图。生成的热图可用于交互式地识别感兴趣的探针和基因。
作者:Tim F. Rayner
维护者:Tim F. Rayner
引文(从R内,输入引用(“ChromHeatMap”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ChromHeatMap”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“ChromHeatMap”)
用ChromHeatMap绘制表达式数据 | ||
参考手册 |
biocViews | 软件,可视化 |
版本 | 1.24.0 |
在Bioconductor | BioC 2.5 (R-2.10)(6.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.9.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),注释(> = 1.20.0),AnnotationDbi(> = 1.4.0) |
进口 | Biobase(>= 2.17.8),图形,grDevices,方法,统计,IRanges,rtracklayer |
链接 | |
建议 | 所有,hgu95av2.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | ChromHeatMap_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | ChromHeatMap_1.24.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | ChromHeatMap_1.24.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | ChromHeatMap_1.24.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/ChromHeatMap/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ChromHeatMap/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |