要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ChIPseqR”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见ChIPseqR.
Bioconductor版本:3.2
ChIPseqR从ChIP-seq和核小体定位实验中识别蛋白质结合位点。用来描述结合事件的模型是为了定位核小体而开发的,但应该足够灵活,可以处理其他类型的实验。
作者:Peter Humburg
维护者:Peter Humburg < Peter。Humburg在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“ChIPseqR”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ChIPseqR”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“ChIPseqR”)
ChIPseqR简介 | ||
参考手册 |
biocViews | ChIPSeq,基础设施,软件 |
版本 | 1.24.1 |
在Bioconductor | BioC 2.5 (R-2.10)(6.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R(>= 2.10.0),方法,BiocGenerics,S4Vectors |
进口 | Biostrings,fBasics,GenomicRanges,IRanges(>= 2.3.13),图形,grDevices,HilbertVis,ShortRead统计数据,timsac,跑龙套 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | ChIPseqR_1.24.1.tar.gz |
Windows二进制 | ChIPseqR_1.24.1.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | ChIPseqR_1.24.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | ChIPseqR_1.24.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/ChIPseqR/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ChIPseqR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |