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此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅冠军。
生物导体版本:3.2
该软件包包括质量控制指标,标准化方法的选择和新型方法,以识别差异化甲基化区域并突出拷贝数畸变。另外,它们是一种使用BS和OXB样品来帮助计算HMC的方法。
作者:Tiffany Morris [CRE,AUT],Lee Butcher [CTB],Andrew Feber [CTB],Andrew Teschendorff [CTB],Ankur Chakravarthy [CTB]
维护者:tiffany Morris
引用(从r内,输入引用(“冠军”)
):
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Browsevignettes(“冠军”)
包裹 | ||
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 库务,,,,甲基化array,,,,微阵列,,,,正常化,,,,软件,,,,两通道 |
版本 | 1.8.2 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(2。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.0.1),Minfi,,,,Champdata,,,,Illumina450probevariants.db |
进口 | SVA,,,,Illuminahumanmethylation450Kmanifest,,,,林玛,,,,rpmm,,,,DNACOPIGY,,,,预处理,,,,算,,,,Marray,,,,西瓜,,,,plyr,,,,iranges,,,,基因组机 |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | Champ_1.8.2.tar.gz |
Windows二进制 | Champ_1.8.2.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | Champ_1.8.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | Champ_1.8.2.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/champ/tree/release-3.2 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/champ/ |
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