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##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ https://www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ champ”)

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冠军

此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅冠军

芯片分析Illumina人甲基化的甲基化管道450

生物导体版本:3.2

该软件包包括质量控制指标,标准化方法的选择和新型方法,以识别差异化甲基化区域并突出拷贝数畸变。另外,它们是一种使用BS和OXB样品来帮助计算HMC的方法。

作者:Tiffany Morris [CRE,AUT],Lee Butcher [CTB],Andrew Feber [CTB],Andrew Teschendorff [CTB],Ankur Chakravarthy [CTB]

维护者:tiffany Morris

引用(从r内,输入引用(“冠军”)):

安装

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文本 消息

细节

生物浏览 库务,,,,甲基化array,,,,微阵列,,,,正常化,,,,软件,,,,两通道
版本 1.8.2
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(2。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.0.1),Minfi,,,,Champdata,,,,Illumina450probevariants.db
进口 SVA,,,,Illuminahumanmethylation450Kmanifest,,,,林玛,,,,rpmm,,,,DNACOPIGY,,,,预处理,,,,,,,,Marray,,,,西瓜,,,,plyr,,,,iranges,,,,基因组机
链接
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包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 Champ_1.8.2.tar.gz
Windows二进制 Champ_1.8.2.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) Champ_1.8.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) Champ_1.8.2.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/champ/tree/release-3.2
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/champ/
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