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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CancerMutationAnalysis。

癌症突变分析

Bioconductor版本:3.2

这个包实现体细胞突变基因和基因簇水平分析方法研究癌症。能够区分方法驱动基因(发挥积极作用在肿瘤发生)和乘客基因(突变的肿瘤样本,但没有参与肿瘤发生)并整合研究设计分为两个阶段。基因片段的方法实现patient-oriented方法计算每个样本基因片段的分数,然后结合他们在样品;gene-oriented方法利用Wilcoxon测试还提供了比较。

作者:乔凡尼Parmigiani Simina m·博卡

维护人员:Simina m·博卡< Simina。博卡在nih.gov >

安装

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PDF		CancerMutationAnalysisTutorial
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	遗传学,软件
版本	1.13.0
Bioconductor自	BioC 2.10 (r - 2.15)(4年)
许可证	GPL许可证(> = 2)+文件
取决于	R (> = 2.10.0),qvalue
进口	AnnotationDbi,limma、方法、统计数据
链接
建议	KEGG.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	CancerMutationAnalysis_1.13.0.tar.gz
Windows二进制	CancerMutationAnalysis_1.13.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	CancerMutationAnalysis_1.13.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	CancerMutationAnalysis_1.13.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/cancermutationanalysis/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CancerMutationAnalysis/
包下载报告	下载数据