要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“CNEr”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见cn.
Bioconductor版本:3.2
守恒非编码元素集的大规模识别和高级可视化。
作者:葛谭<葛。Tan09在imperial.ac.uk>
维护人员:Ge Tan < Ge。Tan09在imperial.ac.uk>
引文(从R内,输入引用(“cn”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“CNEr”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“cn”)
超文本标记语言 | CNE识别和可视化 | |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | DataImport,GeneRegulation,软件,可视化 |
版本 | 1.6.2 |
在Bioconductor | BioC 2.14 (R-3.1)(2年) |
许可证 | GPL-2 |文件LICENSE |
取决于 | R (>= 3.0.2) |
进口 | Biostrings(> = 2.33.4),RSQLite(> = 0.11.4),GenomeInfoDb(> = 1.1.3),GenomicRanges(> = 1.17.11),rtracklayer(> = 1.25.5),XVector(> = 0.5.4),DBI(> = 0.2 7),GenomicAlignments(>= 1.1.9),方法S4Vectors(> = 0.0.4),IRanges(> = 1.99.6) |
链接 | S4Vectors,IRanges,XVector |
建议 | Gviz(> = 1.7.4),RUnit,BiocGenerics,BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/ge11232002/CNEr |
BugReports | https://github.com/ge11232002/CNEr/issues |
全靠我 | |
进口我 | TFBSTools |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | CNEr_1.6.2.tar.gz |
Windows二进制 | CNEr_1.6.2.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | CNEr_1.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | CNEr_1.6.2.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/CNEr/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CNEr/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |