##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“CNAnorm”)

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本，请参见CNAnorm．

肿瘤样本拷贝数畸变的归一化方法

Bioconductor版本:3.2

对低覆盖率(每100-10,000 bp读取一次)高通量测序获得的数据进行比率，GC含量校正和归一化。它执行一个“离散的”标准化，寻找基因组的倍性。如果能发现至少两种倍性状态，它还将提供肿瘤内容。

作者:Stefano Berri ， Henry M. Wood ， Arief Gusnanto 上报道

维护:Stefano Berri

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“CNAnorm”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CNAnorm”)

PDF		CNAnorm.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation，报道，DNASeq，GenomicVariation，归一化，测序，软件，WholeGenome
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R(>= 2.10.1)，方法
进口	DNAcopy
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.r-project.org
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	CNAnorm_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	CNAnorm_1.16.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	CNAnorm_1.16.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	CNAnorm_1.16.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/CNAnorm/tree/release-3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CNAnorm/
软件包下载报告	下载数据