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这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本，请参见篮球选手．

分析CAGE (Cap Analysis of Gene Expression)测序数据，精确定位转录起始位点和启动子组挖掘

Bioconductor版本:3.2

CAGE测序数据的预处理，转录起始位点的鉴定和规范化，转录起始位点簇(启动子)的下游分析。

作者:Vanja Haberle，挪威卑尔根大学生物系< Vanja。Haberle在gmail.com>

维护者:Vanja Haberle < Vanja。Haberle在gmail.com>

安装

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文档

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PDF		篮球选手
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类，HighThroughputSequencing，预处理，测序，软件，转录，可视化
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	， R (>= 2.15.0)，BSgenome
进口	跑龙套,Rsamtools，GenomicRanges，IRanges，data.table，beanplot，rtracklayer，耶鲁大学管理学院，VGAM
链接
建议	BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7，FANTOM3and4CAGE
SystemRequirements
增强了	平行
URL
全靠我
进口我
建议我	seqPattern
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	CAGEr_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	CAGEr_1.12.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	CAGEr_1.12.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	CAGEr_1.12.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/CAGEr/tree/release-3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CAGEr/
软件包下载报告	下载数据