要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ArrayTools”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见ArrayTools.
Bioconductor版本:3.2
该软件包旨在为Affymetrix GeneChips提供质量评估和检测差异表达基因的解决方案,包括3' -阵列和基因1.0-ST阵列。该软件包生成HTML格式的综合分析报告。报告页面上的超链接将指向一系列QC图、处理过的数据和差异表达基因列表。差异表达基因报告在表格格式与注释超链接到在线生物数据库。
作者:吴锡伟,Arthur Li
维护者:Arthur Li
引文(从R内,输入引用(“ArrayTools”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ArrayTools”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“ArrayTools”)
1.底漆 | ||
参考手册 |
biocViews | 注释,DifferentialExpression,微阵列,OneChannel,预处理,质量控制,ReportWriting,软件,StatisticalMethod,可视化 |
版本 | 1.30.0 |
在Bioconductor | BioC 2.3 (R-2.8)(7.5年) |
许可证 | LGPL (>= 2.0) |
取决于 | R (>= 2.7.0),affy(> = 1.23.4),Biobase(>= 2.5.5),方法 |
进口 | affy,Biobase,图形,grDevices,limma,方法,统计,utils,xtable |
链接 | |
建议 | simpleaffy,R2HTML,affydata,affyPLM,genefilter,annaffy,gcrma,hugene10sttranscriptcluster.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | ArrayTools_1.30.0.tar.gz |
Windows二进制 | ArrayTools_1.30.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | ArrayTools_1.30.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | ArrayTools_1.30.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/ArrayTools/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ArrayTools/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |