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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅AnnotationForge。

代码构建注释数据库包

Bioconductor版本:3.2

提供了代码生成注释的包和他们的数据库。生产的目的是用于AnnotationDbi包。

作者:马克•卡尔森Herve页面

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“AnnotationForge”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“AnnotationForge”)

PDF		AnnotationForge:创建选择界面自定义注释资源
PDF		创建探测包
PDF		SQLForge:一个简单的方法来创建一个新的注释包与一个标准的数据库模式。
HTML		制造新的生物包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,基础设施,软件
版本	1.12.2
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 2.7.0)、方法、效用,BiocGenerics(> = 0.15.10),Biobase(> = 1.17.0),AnnotationDbi(> = 1.31.19),org.Hs.eg.db
进口	方法,跑龙套,DBI,RSQLite,BiocGenerics,S4Vectors,Biobase
链接
建议	DBI(> = 0.2 - 4),RSQLite(> = 0.6 - 4),XML,RCurl,hgu95av2.db,human.db0,affy,Homo.sapiens,hom.Hs.inp.db,GO.db,BiocStyle,knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	AnnotationHubData,GGHumanMethCancerPanelv1.db,GOstats
建议我	AnnotationDbi,AnnotationHub
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	AnnotationForge_1.12.2.tar.gz
Windows二进制	AnnotationForge_1.12.2.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	AnnotationForge_1.12.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	AnnotationForge_1.12.2.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/annotationforge/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AnnotationForge/
包下载报告	下载数据