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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ALDEx2。

微分丰富考虑样本变异分析

Bioconductor版本:3.2

微分丰富分析的比较两个或两个以上的条件。例如,单个有机体和meta-RNA-seq高通量测序分析,从体外或选择和选择值序列的选择。使用Dirichlet-multinomial模型推断出从数量丰富,已经优化了实验复制三个或更多。推断抽样变异和计算预期的错误发现率的变异生物和取样使用Wilcox等级测试或韦尔奇学习任务(aldex.ttest)或漠视,和克鲁斯卡尔沃利斯测试(aldex.glm)。报告两个P和罗斯福Benjamini Hochberg校正计算的值。

作者:格雷格•Gloor露丝Grace Wong安德鲁•费尔南德斯阿里亚艾伯特,马特链接

维护人员:格雷格Gloor < ggloor在uwo.ca >

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PDF		R包确定微分丰富的高通量测序实验
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	贝叶斯,ChIPSeq,DNASeq,DifferentialExpression,GeneExpression,RNASeq,测序,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(1.5年)
许可证	文件许可
取决于	方法,SummarizedExperiment
进口	S4Vectors,IRanges,GenomicRanges
链接
建议	平行,BiocParallel
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	ALDEx2_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	ALDEx2_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	ALDEx2_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	ALDEx2_1.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/aldex2/tree/release - 3.2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ALDEx2/
包下载报告	下载数据