要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ adacgh2”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

adacgh2

此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅adacgh2

使用并行计算和FF对象分析ACGH实验的大数据

生物导体版本:3.2

阵列CGH数据的分析和绘制。允许使用圆形二进制分离,基于小波的平滑度(如Liu等人,以及Ben-Yaacov和Eldar中的Haarseg),HMM,Biohmm,Glad,cghseg。大多数计算都是并行的(通过分叉或与群集,包括MPI和插座群集),并使用FF来存储数据。

作者:ramon diaz-uriarte 和oscar M. rueda 。fhcrc.org>的li hsu 上。来自Barry Rowlingson的ImageMap代码。来自Erez Ben-Yaacov的Haarseg代码;从下载。

维护者:ramon diaz-uriarte

引用(从r内,输入引用(“ adacgh2”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ adacgh2”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ adacgh2”)

PDF R脚本 ADACGH2概述
PDF adacgh2长示例.pdf
PDF Benchmarks.pdf
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 库务,,,,微阵列,,,,软件
版本 2.10.0
在生物导体中 Bioc 2.7(R-2.12)(5。5年)
执照 GPL(> = 3)
要看 R(> = 2.15.0),并行,ff
进口 少量,,,,ffbase,,,,DNACOPIGY,,,,蒂格拉里,,,,高兴的,,,,挥手,,,,,,,,ACGH,,,,Snapcgh
链接
建议 cghrigions,,,,开罗,,,,林玛
系统要求
增强 rmpi
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 adacgh2_2.10.0.tar.gz
Windows二进制 adacgh2_2.10.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) adacgh2_2.10.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) adacgh2_2.10.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/adacgh2/tree/release-3.2
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/adacgh2/
软件包下载报告 下载统计

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