beachmat

DOI:10.18129 / B9.bioc.beachmat

编译Bioconductor处理每个矩阵类型

Bioconductor版本:版本(3.17)

提供了一个一致的c++类接口读取和写入数据,选用多种常用的矩阵类型。普通矩阵和稀疏的几个/稠密矩阵类直接支持,第三方S4类可能是由外部链接,而所有其他矩阵是由DelayedArray块处理。

作者:亚伦Lun (aut (cre), Herve页(aut),迈克·史密斯(aut)

维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“beachmat”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“beachmat”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“beachmat”)

HTML R脚本 1。开发人员指南
HTML R脚本 2。读取数据从R矩阵在c++中(v2)
HTML R脚本 3所示。写数据到R矩阵对象(v2)
HTML R脚本 4所示。支持任意的矩阵类(v2)
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport,DataRepresentation,基础设施,软件
版本 2.16.0
Bioconductor自 BioC 3.6 (r - 3.4)(5.5年)
许可证 GPL-3
取决于
进口 方法,DelayedArray(> = 0.15.14),BiocGenerics矩阵,Rcpp
链接 Rcpp
建议 testthat,BiocStyle,rmarkdown knitr rcmdcheck,BiocParallel,HDF5Array
SystemRequirements c++ 11
增强了
URL
取决于我
进口我 后面;,BiocSingular,DropletUtils,mumosa,,食物,天窗,
建议我 bsseq,glmGamPoi,mbkmeans,PCAtools,scCB2
我的链接 BiocSingular,bsseq,DropletUtils,glmGamPoi,mbkmeans,PCAtools,食物,天窗,
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 beachmat_2.16.0.tar.gz
Windows二进制 beachmat_2.16.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) beachmat_2.16.0.tgz
macOS二进制(arm64) beachmat_2.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/beachmat
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ beachmat
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/beachmat/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/beachmat/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网