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TileDBArray
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DOI:10.18129 / B9.bioc.TileDBArray
使用TileDB DelayedArray后端
Bioconductor版本:版本(3.17)
实现了一个DelayedArray端读写稠密或稀疏阵列的TileDB格式。结果TileDBArrays兼容所有可以接受DelayedArray Bioconductor管道实例。
作者:亚伦Lun (aut (cre),基因泰克公司(cph)
维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“TileDBArray”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TileDBArray”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“TileDBArray”)
| HTML | R脚本 | 用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | DataRepresentation,基础设施,软件 |
| 版本 | 1.10.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.12 (r - 4.0)(2.5年) |
| 许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
| 取决于 | DelayedArray(> = 0.15.16) |
| 进口 | 方法、Rcpp tiledb,S4Vectors |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | rmarkdown knitr,矩阵,BiocStyle,BiocParallel,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/LTLA/TileDBArray |
| BugReports | https://github.com/LTLA/TileDBArray |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | TileDBArray_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | TileDBArray_1.10.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | TileDBArray_1.10.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | TileDBArray_1.10.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TileDBArray |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TileDBArray |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/TileDBArray/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TileDBArray/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
