伶盗龙

DOI:10.18129 / B9.bioc.velociraptor

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅伶盗龙

单细胞的工具包速度

Bioconductor版本:3.16

这个包提供了RNA Bioconductor-friendly包装速度计算单细胞RNA-seq数据。我们使用的是蛇怪包管理Conda环境,和zellkonverter包SingleCellExperiment之间转换数据结构(R)和AnnData (Python)。速度的方法产生的信息存储在SingleCellExperiment类的各种组件。

作者:凯文Rue-Albrecht (aut (cre)亚伦Lun (aut),夏洛特Soneson (aut)迈克尔·施(aut)

维护人员:凯文Rue-Albrecht < kevinrue67 gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“迅猛龙”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“迅猛龙”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“迅猛龙”)

HTML R脚本 用户指南
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 报道,GeneExpression,测序,SingleCell,软件
版本 1.8.0
Bioconductor自 BioC 3.12 (r - 4.0)(2.5年)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于 SummarizedExperiment
进口 方法、统计数据矩阵,BiocGenerics网状,S4Vectors,DelayedArray,蛇怪,zellkonverter,天窗,SingleCellExperiment,BiocParallel,BiocSingular
链接
建议 BiocStyle,knitr testthat rmarkdown pkgdown,食物,,scRNAseq,图形Rtsne grDevices、ggplot2 cowplot, GGally,东拼西凑,metR
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/kevinrue/velociraptor
BugReports https://github.com/kevinrue/velociraptor/issues
取决于我 OSCA.advanced
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 velociraptor_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 velociraptor_1.8.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) velociraptor_1.8.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/velociraptor
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/迅猛龙
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/velociraptor/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/velociraptor/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网