uncoverappLib

DOI:10.18129 / B9.bioc.uncoverappLib

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅uncoverappLib。

交互式图形应用临床评估碱基对序列覆盖的水平

Bioconductor版本:3.16

一个闪亮的应用程序包含一套图形和统计工具来支持低覆盖地区的临床评估。它显示三个web页面提供一个不同的分析模块:房颤覆盖分析,计算等位基因频率的应用和二项分布。uncoverAPP提供statisticl总结覆盖目标文件或基因的名字。

作者:Emanuela Iovino (cre, aut),托马索Pippucci (aut)

维护人员:Emanuela Iovino < Emanuela。在unibo.it iovino >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“uncoverappLib”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“uncoverappLib”)

HTML	R脚本	uncoverappLib
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	注释,报道,软件,可视化
版本	1.8.1
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于
进口	减价,有光泽,shinyjs shinyBS、shinyWidgets shinycssloaders, DT,Gviz,Homo.sapiens,condformat openxlsx stringr,org.Hs.eg.db,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene,BiocFileCacherappdirs,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGenerlist跑龙套,S4Vectors,EnsDb.Hsapiens.v75,EnsDb.Hsapiens.v86,OrganismDbiprocessx,Rsamtools,GenomicRanges
链接
建议	BiocStyle,testthat knitr rmarkdown dplyr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/Manuelaio/uncoverappLib
BugReports	https://github.com/Manuelaio/uncoverappLib/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	uncoverappLib_1.8.1.tar.gz
Windows二进制	uncoverappLib_1.8.1.zip
macOS二进制(x86_64)	uncoverappLib_1.8.1.tgz
macOS二进制(arm64)	uncoverappLib_1.8.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/uncoverappLib
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ uncoverappLib
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/uncoverappLib/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/uncoverappLib/
包下载报告	下载数据