这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅panelcn.mops。
Bioconductor版本:3.16
CNV检测目标门店面板数据的工具。cn的延伸。拖把包。
作者:Verena Haunschmid (aut) Gundula Povysil (aut (cre)
维护人员:Gundula Povysil < Povysil在bioinf.jku.at >
从内部引用(R,回车引用(“panelcn.mops”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“panelcn.mops”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“panelcn.mops”)
R脚本 | panelcn.mops: Manual for the R package | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CellBiology,CopyNumberVariation,遗传学,GenomicVariation,测序,软件,VariantDetection |
版本 | 1.20.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(5.5年) |
许可证 | LGPL (> = 2.0) |
取决于 | R (> = 3.5.0),cn.mops、方法、跑龙套、统计数据、图形 |
进口 | GenomicRanges,Rsamtools,IRanges,S4Vectors,GenomeInfoDb,grDevices |
链接 | |
建议 | RUnit knitr, rmarkdown,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | CopyNumberPlots |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | panelcn.mops_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | panelcn.mops_1.20.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | panelcn.mops_1.20.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | panelcn.mops_1.20.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/panelcn.mops |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ panelcn.mops |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/panelcn.mops/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/panelcn.mops/ |
包下载报告 | 下载数据 |