omicsPrint

DOI:10.18129 / B9.bioc.omicsPrint

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅omicsPrint。

十字架使基因指纹分析

Bioconductor版本:3.16

omicsPrint提供了交叉功能使遗传指纹分析,例如,来验证样品多个组学数据类型之间的关系,即基因组、转录组、表观遗传(DNA甲基化)。

作者:范Iterson (aut)戴维猫(cre)

维护人员:戴维猫< davycats。直流gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“omicsPrint”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“omicsPrint”)

HTML	R脚本	omicsPrint:检测数据在多个组学研究链接错误
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation,表观遗传学,GeneticVariability,遗传学,ImmunoOncology,质量控制,软件,转录,转录组
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 3.5),质量
进口	方法、matrixStats图形,统计数据,SummarizedExperiment,MultiAssayExperiment,RaggedExperiment
链接
建议	BiocStyle,rmarkdown knitr testthat,GEOquery,VariantAnnotation,Rsamtools,BiocParallel,GenomicRanges,FDb.InfiniumMethylation.hg19,snpStats
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	omicsPrint_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	omicsPrint_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64)	omicsPrint_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64)	omicsPrint_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/omicsPrint
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ omicsPrint
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/omicsPrint/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/omicsPrint/
包下载报告	下载数据