Omicrexposom

doi:10.18129/b9.bioc.omicrexposome

这是发展Omicrexposome的版本;对于稳定版本,请参阅Omicrexposom

外向数据协会和集成分析

生物导体版本:开发(3.16)

OMICREXPOSOME系统地将暴露与OMIC数据之间的关联评估系统化,利用多ataTASET用于协调的数据管理,rexposoms用于exposome数据定义和关联测试的LIMMA。还可以使用多共同分析(Omicade4)和多典型相关分析(PMA)执行数据集成混合示波器和OMIC数据。

作者:Carles Hernandez-Ferrer [AUT,CRE],Juan R.González[aut]

维护者:XavierEscribàMontagut

引用(从r内,输入引用(“ imicrexposome”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ omiCrexposome”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ omicrexposome”)

html R脚本 与OMIC数据相结合
PDF 参考手册
文本 执照

细节

生物浏览 差异性,,,,差甲基化,,,,表观遗传学,,,,基因表达,,,,结肠管制,,,,免疫学,,,,多重组合,,,,蛋白质组学,,,,回归,,,,软件,,,,统计信息,,,,转录组学,,,,可视化,,,,工作流程
版本 1.19.0
在生物导体中 Bioc 3.6(R-3.4)(5年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 r(> = 3.5.0),生物酶
进口 统计,UTILS,GRDEVICES,图形,方法,rexposom,,,,林玛,,,,SVA,,,,GGPLOT2,,,,Ggrepel,,,,PMA,,,,Omicade4,,,,栅格,,,,多胎,,,,Smartsva,,,,ISVA, 平行,总结性特征,,,,Stringr
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,snpstats,,,,Brgedata
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 omicrexposome_1.19.0.tar.gz
Windows二进制 omicrexposome_1.19.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) omicrexposome_1.19.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/omicrexposome
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/omicrexposome
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/omicrexposome/
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