这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅msgbsR。
Bioconductor版本:3.16
管道的分析MS-GBS实验。
作者:本杰明·梅恩
维修工:本杰明·梅恩<本杰明。梅恩在adelaide.edu.au >
从内部引用(R,回车引用(“msgbsR”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“msgbsR”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“msgbsR”)
R脚本 | msgbsR_Example | |
参考手册 |
biocViews | DataImport,DifferentialMethylation,表观遗传学,ImmunoOncology,MethylSeq,软件 |
版本 | 1.22.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.5 (r - 3.4)(6年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = 3.5.0),GenomicRanges、方法 |
进口 | BSgenome,easyRNASeq,刨边机,GenomicAlignments,GenomicFeatures,GenomeInfoDb,ggbioggplot2,IRanges、平行、plyrRsamtools,R。跑龙套,统计数据,SummarizedExperiment,S4Vectors,跑龙套 |
链接 | |
建议 | roxygen2,BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn6 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | msgbsR_1.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | msgbsR_1.22.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | msgbsR_1.22.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | msgbsR_1.22.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msgbsR |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ msgbsR |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/msgbsR/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/msgbsR/ |
包下载报告 | 下载数据 |