mirTarRnaSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.mirTarRnaSeq

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅mirTarRnaSeq。

mirTarRnaSeq

Bioconductor版本:3.16

mirTarRnaSeq R包可用于交互式mRNA microrna的排序统计分析。这个包利用表达式或微分表达式mRNA和microrna的测序结果和执行互动关系和各种GLM(定期的漠视、多元的漠视,和交互GLM)分析之间的信使rna和microrna的实验。可以时间点实验,这些实验或实验条件。

作者:Mercedeh Movassagh (aut (cre)伊瑞,莎拉·莫顿(aut),拉斐尔(aut),约瑟夫·杰弗里•贝利(aut) N保尔森(aut)

维护人员:Mercedeh Movassagh < Mercedeh ds.dfci.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“mirTarRnaSeq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“mirTarRnaSeq”)

PDF	R脚本	mirTarRnaSeq
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression,回归,测序,SmallRNA,软件,TimeCourse,microrna的
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(2年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.1.0), ggplot2
进口	pscl purrr,质量,为了,caTools dplyr, pheatmap, reshape2, corrplot, grDevices、图形、属性、跑龙套,数据。表,R.utils
链接
建议	BiocStyle,rmarkdown knitr R.cache,海绵
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	mirTarRnaSeq_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	mirTarRnaSeq_1.6.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	mirTarRnaSeq_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64)	mirTarRnaSeq_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mirTarRnaSeq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ mirTarRnaSeq
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/mirTarRnaSeq/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/mirTarRnaSeq/
包下载报告	下载数据