米娅

doi：10.18129/b9.bioc.mia

这是发展MIA的版本；对于稳定版本，请参阅米娅。

微生物组分析

生物导体版本：开发（3.16）

MIA基于总结性特征，单链体和树木化的特权基础设施来实现微生物组分析的工具。在分类数据的背景下，数据争吵和分析是主要范围。实施了共同任务的其他功能，例如社区指数计算和汇总。

作者：Felix G.M.恩斯特[aut]，Sudarshan A. Shetty [aut]，Tuomas Borman [AUT，CRE]，Leo Lahti [aut]，Yang Cao [CTB]，Nathan D. Olson [CTB]，Levi Waldron [CTB]，Marcel Ramos [CTB]，HéctorCorrada Bravo [CTB]，Jayaram Kancherla [CTB]，Domenick Braccia [CTB] [CTB] [CTB] [CTB]

维护者：tuomas borman

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ mia”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Mia”）

html	R脚本	米娅
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	DataImport，，，，微生物组，，，，软件
版本	1.5.9
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1年）
执照	Artistic-2.0 |文件执照
要看	r（> = 4.0），总结性特征，，，，Singlecellexperiment，，，，树木化的特殊性（> = 1.99.3），多亚sayExexperiment
进口	方法，统计，utils，大量的，，，，猿，，，，Decontam，，，，素食主义者，，，，生物基因，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，生物弦，，，，解码，，，，生物比较，，，，延迟，，，，延迟的matrixstats，，，，砍伐，，，，评分，，，，dirichletmultinomial，，，，rlang，，，，dplyr，，，，蒂布尔，，，，花花公子
链接
建议	测试，，，，尼特，，，，拼布，，，，生物使用，，，，Yaml，，，，门索，，，，Dada2，，，，Stringr，，，，生物形式，，，，枯萎病，，，，ADE4，，，，微生物膜，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	https://github.com/microbiome/mia
BugReports	https://github.com/microbiome/mia/issues
取决于我	迈维兹
进口我	策划的元素元素
建议我	CBEA，，，，菲尔
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	mia_1.5.9.9.tar.gz
Windows二进制	mia_1.5.9.9.zip
MacOS 10.13（高山脉）	mia_1.5.9.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mia
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/MIA
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/mia/
软件包下载报告	下载统计