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miRLAB
DOI:10.18129 / B9.bioc.miRLAB
这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅miRLAB。
干实验室探索miRNA-mRNA关系
Bioconductor版本:3.16
提供工具探索miRNA-mRNA关系,包括流行的microrna的目标预测方法、整体集成单个方法的方法,功能从网络资源获取数据,进行功能验证的结果,和功能富集分析。
作者:Thuc Duy勒,Junpeng张莫陈,Vu Viet黄平君范教授
维护人员:Thuc Duy Le < Thuc。勒在unisa.edu.au >
从内部引用(R,回车引用(“miRLAB”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“miRLAB”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“miRLAB”)
| HTML | R脚本 | miRLAB |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneExpression,网络,NetworkInference,软件,microrna的 |
| 版本 | 1.28.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(7.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | |
| 进口 | 方法、统计跑龙套,RCurl、httr stringr, Hmisc、能量、熵,gplots, glmnet,嫁祸于,limmapcalg,TCGAbiolinksdplyr,SummarizedExperiment,ctcInvariantCausalPrediction,类别,GOstats,org.Hs.eg.db |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,BiocGenerics,AnnotationDbiRUnit, rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/pvvhoang/miRLAB |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | miRLAB_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | miRLAB_1.28.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | miRLAB_1.28.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | miRLAB_1.28.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRLAB |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miRLAB |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/miRLAB/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/miRLAB/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
