mgsa

DOI:10.18129 / B9.bioc.mgsa

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅mgsa。

基于模型的基因集分析

Bioconductor版本:3.16

基于模型的基因集分析(MGSA)是基因集富集的贝叶斯建模方法。包mgsa实现mgsa和工具一起使用mgsa基因本体。

作者:塞巴斯蒂安·鲍尔在sebastianbauer.info > <邮件,朱利安Gagneur < Gagneur在genzentrum.lmu.de >

维修工:塞巴斯蒂安·鲍尔<邮件在sebastianbauer.info >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“mgsa”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“mgsa”)

PDF	R脚本	mgsa包的概述。
PDF		参考手册

细节

biocViews	去,GeneSetEnrichment,通路,软件
版本	1.46.0
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(12年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 2.14.0)方法,gplots
进口	图形、统计、跑龙套
链接
建议	DBI RSQLite,GO.db,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/sba1/mgsa-bioc
取决于我
进口我
建议我	pareg
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	mgsa_1.46.0.tar.gz
Windows二进制	mgsa_1.46.0.zip
macOS二进制(x86_64)	mgsa_1.46.0.tgz
macOS二进制(arm64)	mgsa_1.46.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mgsa
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ mgsa
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/mgsa/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/mgsa/
包下载报告	下载数据