makecdfenv

DOI:10.18129 / B9.bioc.makecdfenv

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅makecdfenv。

提供环境制造商

Bioconductor版本:3.16

这个包有两个功能。一个读取Affymetrix芯片描述文件(CDF)并创建一个哈希表环境包含位置/探针集员映射。另外创建一个包,自动加载该环境。

作者:拉斐尔·a·伊<拉法在jhu.edu >, Laurent Gautier < cbs.dtu劳伦。dk >, <沃尔夫冈Huber w。胡贝尔在dkfz-heidelberg.de >,本Bolstad < bmb bmbolstad.com >

维修工:詹姆斯·w·麦克唐纳在u.washington.edu < jmacdon >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“makecdfenv”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“makecdfenv”)

PDF	R脚本	makecdfenv底漆
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport,OneChannel,预处理,软件
版本	1.74.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 18岁)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.6.0),affyio
进口	Biobase,affy、方法、统计跑龙套,zlibbioc
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	altcdfenvs
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	makecdfenv_1.74.0.tar.gz
Windows二进制	makecdfenv_1.74.0.zip
macOS二进制(x86_64)	makecdfenv_1.74.0.tgz
macOS二进制(arm64)	makecdfenv_1.74.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/makecdfenv
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ makecdfenv
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/makecdfenv/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/makecdfenv/
包下载报告	下载数据