莱斯

DOI:10.18129 / B9.bioc.les

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅莱斯

确定微分影响瓷砖微阵列数据

Bioconductor版本:3.16

莱斯的包估计位点增强的意义(les)瓷砖微阵列数据。这些地区的监管在微分转录,如发现CHiP-chip或修改DNA分析。包提供了一个通用框架适用于瓷砖确定微分效应微阵列数据集,并独立于底层数据的单探针。

作者:朱利安格林克莱门斯克鲁兹,Jens蒂莫

维护人员:朱利安格林< jg-bioc gmx.com >

从内部引用(R,回车引用(les)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(les)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

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PDF R脚本 介绍les包:确定微分影响瓷砖微阵列数据的位点增强意义框架
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews ChIPchip,DNAMethylation,DifferentialExpression,微阵列,软件,转录
版本 1.48.0
Bioconductor自 BioC 2.7 (r - 2.12)(12.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R(> = 2.13.2)方法,图形,fdrtool
进口 引导、gplots RColorBrewer
链接
建议 Biobase,limma
SystemRequirements
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 les_1.48.0.tar.gz
Windows二进制 les_1.48.0.zip
macOS二进制(x86_64) les_1.48.0.tgz
macOS二进制(arm64) les_1.48.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/les
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/莱斯
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/les/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/les/
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