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imageHTS
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DOI:10.18129 / B9.bioc.imageHTS
基于高通量显微镜的屏幕分析
Bioconductor版本:发行版(3.16)
imagets是一个R包，专门用于分析基于高通量显微镜的屏幕。该软件包提供了一个模块化和可扩展的框架来分割细胞，提取定量细胞特征，预测细胞类型和通过web界面浏览屏幕数据。imagets旨在在分布式环境中运行，提供了对远程数据的标准化访问，并促进了基于显微镜的高通量数据集的传播。
作者:Gregoire Pau, Zhang Xian, Michael Boutros, Wolfgang Huber
维护者:Joseph Barry < Joseph。Barry在embl.de>
引文(从R内，输入引用(“imageHTS”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“imageHTS”)
| R脚本 | 基于imagets的高通量显微屏幕分析 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | CellBasedAssays，ImmunoOncology，预处理，软件，可视化 |
| 版本 | 1.48.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.7 (R-2.12)(12年) |
| 许可证 | lgpl - 2.1 |
| 取决于 | R (>= 2.9.0)，EBImage(> = 4.3.12),cellHTS2(> = 2.10.0) |
| 进口 | 工具,Biobase，hwriter、方法、vsn，统计，utils，e1071 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，质量 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | imageHTS_1.48.0.tar.gz |
| Windows二进制 | imageHTS_1.48.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | imageHTS_1.48.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | imageHTS_1.48.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/imageHTS |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/imageHTS |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/imageHTS/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/imageHTS/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
