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的热图
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DOI:10.18129 / B9.bioc.heatmaps
灵活的热图序列为功能基因组学和功能
Bioconductor版本:版本(3.16)
这个包提供函数来绘制的热图跨基因组的全基因组数据的间隔,如ChIP-seq信号的峰值和推动者。许多功能也提供调查序列特性。
作者:马尔科姆·佩里在gmail.com < mgperry32 >
维护人员:马尔科姆·佩里在gmail.com < mgperry32 >
从内部引用(R,回车引用(“热图”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“热图”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“热图”)
| HTML | R脚本 | 装饰图案的标题 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | FunctionalGenomics,SequenceMatching,软件,可视化 |
| 版本 | 1.22.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.5 (r - 3.4)(5.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.5.0) |
| 进口 | 方法、grDevices图形,统计数据,Biostrings,GenomicRanges,IRanges,KernSmooth,plotrix,矩阵,EBImage,RColorBrewer,BiocGenerics,GenomeInfoDb |
| 链接 | |
| 建议 | BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7,knitr,rmarkdown,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | heatmaps_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | heatmaps_1.22.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | heatmaps_1.22.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | heatmaps_1.22.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/heatmaps |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/热图 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/heatmaps/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/heatmaps/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
