gwascat

DOI:10.18129 / B9.bioc.gwascat

在EMBL-EBI GWAS目录中表示和建模数据

Bioconductor版本:发行版(3.16)

在EMBL-EBI GWAS目录中表示和建模数据。

作者:VJ Carey

维护者:VJ Carey

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“gwascat”)

超文本标记语言	R脚本	gwascat—EBI目录中GWAS命中的GRanges
超文本标记语言	R脚本	gwascat:构造和查询NHGRI GWAS目录
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	遗传学，软件
版本	2.30.0
在Bioconductor	BioC 2.10 (R-2.15)(11年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.5.0)，方法
进口	S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges(> = 1.29.6),GenomicFeatures，readr，Biostrings，AnnotationDbi，BiocFileCache，snpStats，VariantAnnotation，AnnotationHub
链接
建议	DO.db，DT，knitr，RBGL，testthat，rmarkdown，dplyr，Gviz，Rsamtools，rtracklayer，图，ggbio，DelayedArray，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，org.Hs.eg.db，BiocStyle
SystemRequirements
增强了	SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37
URL
全靠我	liftOver，vtpnet
进口我	circRNAprofiler
建议我	GenomicScores，grasp2db，hmdbQuery，ldblock，parglms，TFutils
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	gwascat_2.30.0.tar.gz
Windows二进制	gwascat_2.30.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	gwascat_2.30.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	gwascat_2.30.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gwascat
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/gwascat
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/gwascat/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/gwascat/
软件包下载报告	下载数据