ggmanh

DOI:10.18129 / B9.bioc.ggmanh

GWAS结果的可视化工具

Bioconductor版本:发行版(3.16)

曼哈顿图(Manhattan plot)和QQ图(QQ plot)是基因组关联研究(Genome Wide Association Study)的常用图形。“ggmanh”包旨在保持这些图的生成简单，同时保持可定制性。主要功能有manhattan an_plot、qqunif、thinPoints等。

作者:John Lee [aut, cre]，郑秀文[ctb, dtc]

维护者:John Lee < John。李在abbvie.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ggmanh”)

超文本标记语言	R脚本	ggmanh包指南
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	遗传学，GenomeWideAssociation，软件，可视化
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.15 (R-4.2)(1年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	方法,ggplot2
进口	gdsfmt，ggrepelgrDevices,RColorBrewer，rlang，尺度，SeqArray(>= 1.32.0)， stats
链接
建议	BiocStyle，rmarkdown，knitr，testthat(> = 3.0.0),减价，GenomicRanges
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	SAIGEgds
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ggmanh_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	ggmanh_1.2.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	ggmanh_1.2.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	ggmanh_1.2.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggmanh
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ggmanh
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ggmanh/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ggmanh/
软件包下载报告	下载数据