- 家
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- geNetClassifier
geNetClassifier
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DOI:10.18129 / B9.bioc.geNetClassifier
疾病分类和构建基因网络使用相关基因表达谱
Bioconductor版本:版本(3.16)
综合方案自动训练和验证一个多层次SVM分类器基于基因表达数据。提供透明的选择的基因标记,coexpression网络,查询分类器的接口。
作者:Sara Aibar,西莉亚Fontanillo和哈维尔·De Las里瓦斯。生物信息学与功能基因组学。癌症研究中心(CiC-IBMCC CSIC / USAL)。萨拉曼卡。西班牙。
维护人员:莎拉Aibar < saibar在usal.es >
从内部引用(R,回车引用(“geNetClassifier”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“geNetClassifier”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“geNetClassifier”)
| R脚本 | geNetClassifier-vignette | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 分类,DifferentialExpression,微阵列,软件 |
| 版本 | 1.38.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.12 (r - 3.0)(10年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 2.10.1),Biobase(> = 2.5.5),EBarrays,minet、方法 |
| 进口 | e1071、图形grDevices |
| 链接 | |
| 建议 | leukemiasEset,RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | RColorBrewer,igraph,infotheo |
| URL | http://www.cicancer.org |
| 取决于我 | |
| 进口我 | bioCancer,癌症 |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | geNetClassifier_1.38.0.tar.gz |
| Windows二进制 | geNetClassifier_1.38.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | geNetClassifier_1.38.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | geNetClassifier_1.38.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geNetClassifier |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ geNetClassifier |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/geNetClassifier/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/geNetClassifier/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
