flowWorkspace

DOI:10.18129 / B9.bioc.flowWorkspace

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅flowWorkspace。

基础设施代表与封闭的交互和闭塞的血细胞计数数据集。

Bioconductor版本:3.16

这个包是为了方便比较自动控制方法与手工浇注在flowJo完成。这个包让你基本flowJo工作区导入BioConductor和复制flowJo使用flowCore功能的控制。控制层次结构,样品组、补偿和转换,以便执行输出匹配flowJo分析。

作者:迈克格雷格•Finak江

维修工:格雷格Finak格雷格•ozette.com > <迈克江迈克< ozette.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“flowWorkspace”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“flowWorkspace”)

HTML	R脚本	flowWorkspace简介:一个包来存储和maninpulate封闭的流数据
HTML	R脚本	如何合并GatingSets
PDF		参考手册
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文本		安装
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport,DataRepresentation,FlowCytometry,ImmunoOncology,预处理,软件
版本	4.10.1
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(11.5年)
许可证	agpl - 3.0
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	Biobase,BiocGenerics,cytolib(> = 2.3.9)、XML、ggplot2图、图形、grDevices方法、统计stats4,跑龙套,RBGL、工具、Rgraphviz、数据。表、dplyr尺度、matrixStatsRProtoBufLib,flowCore(> = 2.1.1)ncdfFlow(> = 2.25.4),DelayedArray,S4Vectors
链接	cpp11,黑洞(> = 1.62.0-1),RProtoBufLib(> = 1.99.4),cytolib(> = 2.3.7),Rhdf5lib
建议	testthat,flowWorkspaceData(> = 2.23.2)、knitr rmarkdown,ggcyto平行,CytoML,openCyto
SystemRequirements	GNU, c++ 11
增强了
URL
取决于我	ggcyto,highthroughputassays
进口我	CytoML,flowDensity,flowStats,ImmuneSpaceR,openCyto,PeacoQC
建议我	催化剂,指南针,flowClust,flowCore,FlowSOM
我的链接	CytoML
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	flowWorkspace_4.10.1.tar.gz
Windows二进制	flowWorkspace_4.10.1.zip
macOS二进制(x86_64)	flowWorkspace_4.10.1.tgz
macOS二进制(arm64)	flowWorkspace_4.10.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowWorkspace
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ flowWorkspace
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/flowWorkspace/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/flowWorkspace/
包下载报告	下载数据