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doppelgangR
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DOI:10.18129 / B9.bioc.doppelgangR
从基因组或元数据中识别可能的重复样本
Bioconductor版本:发行版(3.16)
主要函数是doppelgangR()，它将ExpressionSet对象的列表作为最小输入，并搜索所有列表对以寻找重复的样本。搜索基于基因组数据(exprs(eset))、表型/临床数据(pData(eset))和“确凿的证据”——在pData(eset)中发现的唯一标识符。
作者:Levi Waldron [aut, cre]， Markus Reister [aut, ctb]， Marcel Ramos [ctb]
维护者:Levi Waldron
引文(从R内，输入引用(“doppelgangR”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“doppelgangR”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | doppelgangR装饰图案 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneExpression，ImmunoOncology，微阵列，质量控制，RNASeq，软件 |
| 版本 | 1.26.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.3 (R-3.3)(7年) |
| 许可证 | GPL (> = 2.0) |
| 取决于 | R (>= 3.5.0)，Biobase，BiocParallel |
| 进口 | 股东价值分析，嫁祸于，消化，mnormt，方法，grDevices，图形，统计，SummarizedExperiment,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，rmarkdown，curatedOvarianData，testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/lwaldron/doppelgangR |
| BugReports | https://github.com/lwaldron/doppelgangR/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | doppelgangR_1.26.0.tar.gz |
| Windows二进制 | doppelgangR_1.26.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | doppelgangR_1.26.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | doppelgangR_1.26.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/doppelgangR |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/doppelgangR |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/doppelgangR/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/doppelgangR/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
