不和谐的

DOI:10.18129 / B9.bioc.discordant

不协调法:微分相关的一种新方法

Bioconductor版本:发行版(3.16)

Discordant是一个R包，用于识别表型组之间不同相关的特征对，并应用于组学数据集。Discordant使用一种混合模型，根据分子特征对的共表达类型或共丰度“分类”。算法在“测序数据的差分相关”(Siska et al. 2016)中进一步解释。

作者:Charlotte Siska [aut]， McGrath Max [aut, cre]， Katerina Kechris [aut, cph, ths]

维护:McGrath Max < Max。McGrath在ucdenver。edu>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" inconsistent ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“不和谐”)

超文本标记语言	R脚本	不一致R包:微分相关的一种新方法
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细节

biocViews	BiologicalQuestion，遗传学，ImmunoOncology，微阵列，RNASeq，软件，StatisticalMethod，mRNAMicroarray
版本	1.22.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(6年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.1.0)
进口	Rcpp，Biobase统计数据,biwt，gtools，质量、工具、dplyr，方法，utils
链接	Rcpp
建议	BiocStyle，knitr，testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/siskac/discordant
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	discordant_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	discordant_1.22.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	discordant_1.22.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	discordant_1.22.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/discordant
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/discord
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/discordant/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/discordant/
软件包下载报告	下载数据