derfinderPlot

DOI:10.18129 / B9.bioc.derfinderPlot

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅derfinderPlot。

绘图函数derfinder

Bioconductor版本:3.16

这个包提供了绘图函数结果derfinder包。这有助于独立所需的图形依赖使这些阴谋derfinder的核心功能。

作者:达芬奇Collado-Torres (aut (cre)安德鲁·e·贾菲(aut)黑色,杰弗里·t .韭菜(aut)

维护人员:达芬奇Collado-Torres < lcolladotor gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“derfinderPlot”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“derfinderPlot”)

HTML	R脚本	介绍derfinderPlot
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,可视化
版本	1.32.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.2)
进口	derfinder(> = 1.1.0),GenomeInfoDb(> = 1.3.3),GenomicFeatures,GenomicRanges(> = 1.17.40),ggbio(> = 1.13.13)ggplot2、图形grDevices,IRanges(> = 1.99.28),limma、方法、plyr RColorBrewer reshape2,S4Vectors(> = 0.9.38),鱼鳞,跑龙套
链接
建议	biovizBase(> = 1.27.2),bumphunter(> = 1.7.6),derfinderData(> = 0.99.0)、sessioninfo knitr (> = 1.6),BiocStyle(> = 2.5.19),org.Hs.eg.db、RefManageR rmarkdown (> = 0.3.3) testthat,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,covr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/leekgroup/derfinderPlot
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/derfinderPlot
取决于我
进口我	brainflowprobes,recountWorkflow
建议我	derfinder,GenomicState,regionReport
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	derfinderPlot_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	derfinderPlot_1.32.0.zip
macOS二进制(x86_64)	derfinderPlot_1.32.0.tgz
macOS二进制(arm64)	derfinderPlot_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/derfinderPlot
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ derfinderPlot
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/derfinderPlot/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/derfinderPlot/
包下载报告	下载数据