HCAData

DOI:10.18129 / B9.bioc.HCAData

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅HCAData。

访问数据集的人类细胞在R / Bioconductor地图集

Bioconductor版本:3.16

这个包允许直接访问数据集生成的人类细胞R和Bioconductor Atlas项目进行进一步处理,在舒适的格式SingleCellExperiment对象(可用在其他格式:http://preview.data.humancellatlas.org/)。

作者:费德里科•马里尼(aut (cre)

维护人员:费德里科•马里尼< marinif在uni-mainz.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“HCAData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“HCAData”)

HTML	R脚本	人类细胞图谱数据集访问
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,RNASeqData,SingleCellData
版本	1.14.0
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.6),SingleCellExperiment
进口	ExperimentHub,AnnotationHub,HDF5Array,跑龙套
链接
建议	knitr rmarkdown,BiocStyle,食物(> = 1.11.4),BiocSingular,嘘,天窗Rtsne igraph,iSEE,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/federicomarini/HCAData
取决于我	OSCA.workflows
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	HCAData_1.14.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HCAData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HCAData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HCAData/
包下载报告	下载数据