腰带
DOI:10.18129 / B9.bioc.cummeRbund
这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅腰带。
分析、勘探、操纵和袖扣高通量测序数据的可视化。
Bioconductor版本:3.16
允许持久存储、访问、勘探和袖扣高通量测序数据的操作。此外,提供了大量的绘图函数常用的可视化。
作者:l·高夫,c·杰尔·d·凯利
维护人员:忠诚的a·高夫< lgoff csail.mit.edu >
从内部引用(R,回车引用(腰带)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“腰带”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(腰带)
| R脚本 | 腰带用户指南 | |
| R脚本 | 样本腰带工作流 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 自述 | |
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 生物信息学,聚类,DataImport,DataRepresentation,DifferentialExpression,GeneExpression,HighThroughputSequencing,HighThroughputSequencingData,基础设施,MultipleComparisons,质量控制,RNAseq,RNAseqData,软件,可视化 |
| 版本 | 2.40.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.9 (r - 2.14)(11.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 2.7.0),BiocGenerics(> = 0.3.2)RSQLite、ggplot2 reshape2, fastcluster,rtracklayer,Gviz |
| 进口 | 方法、plyrBiocGenerics,S4Vectors(> = 0.9.25),Biobase |
| 链接 | |
| 建议 | 集群、plyr NMFN stringr,GenomicFeatures,GenomicRanges,rjson |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | cummeRbund_2.40.0.tar.gz |
| Windows二进制 | cummeRbund_2.40.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | cummeRbund_2.40.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | cummeRbund_2.40.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cummeRbund |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/腰带 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/cummeRbund/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cummeRbund/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
