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countsimQC
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DOI:10.18129 / B9.bioc.countsimQC
比较计数数据集的特征特征
Bioconductor版本:发行版(3.16)
countsimQC提供了创建一个综合报告的功能，该报告比较了一组计数矩阵的广泛特征。一个重要的用例是将一个或多个合成计数矩阵与真实计数矩阵(可能是模拟的基础矩阵)进行比较。然而，任何计数矩阵集合都可以进行比较。
作者:Charlotte Soneson [aut, cre]
维护者:Charlotte Soneson
引文(从R内，输入引用(“countsimQC”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“countsimQC”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | countsimQC用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ExperimentalDesign，ImmunoOncology，微生物组，质量控制，RNASeq，ReportWriting，SingleCell，软件，可视化 |
| 版本 | 1.16.1 |
| 在Bioconductor | BioC 3.8 (R-3.5)(4.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (>= 3.5) |
| 进口 | rmarkdown(> = 2.5),刨边机，DESeq2(> = 1.16.0),dplyr，tidyr，ggplot2设备，工具，SummarizedExperiment，genefilter，DT，GenomeInfoDbData，caTools，randtests，统计，utils，方法，ragg |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/csoneson/countsimQC |
| BugReports | https://github.com/csoneson/countsimQC/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | 马斯喀特 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | countsimQC_1.16.1.tar.gz |
| Windows二进制 | countsimQC_1.16.1.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | countsimQC_1.16.1.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | countsimQC_1.16.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/countsimQC |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/countsimQC |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/countsimQC/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/countsimQC/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
| BioC 3.16的旧源包 | 源存档 |
